澳大利亚研究人员开发了一种识别沙门氏菌菌株的标准化方法，以更好地帮助追踪食源性疫情。
这种方法被称为多级基因组分型(MGT)，利用一组数字或条形码给每个细菌菌株一个唯一的身份。
悉尼新南威尔士大学生物技术和生物分子科学学院的兰瑞廷教授告诉我们，他们设计了一种利用细菌基因组比较细菌的方法。
在这项研究中，他们对沙门氏菌进行了研究，这是一种常见的食源性病原体，导致了世界各地的食物中毒和食物爆发。
沙门氏菌菌株的基因组有超过400万个碱基(a - t - c - g)。兰说，目前有许多方法用于比较菌株和追踪疫情，比如单核苷酸多态性(SNP)方法。
用于检测食源性病原体的传统方法没有标准化。此外，根据菌株的数量，它们可能需要数小时到数天的时间进行比较，兰说。
在他们的方法中，研究小组将400万个沙门氏菌的碱基转换成9个不同的数字，这样每个独特的菌株就会附着在9个数字上，兰说，这实际上就变成了该菌株的条形码。
“你分离细菌，测序基因组，然后用我们的方法计算它，如果所有9个数字匹配，它本质上是相同的菌株。结果将立竿见影。”
此外，该小组还建立了一个用于公共卫生的数据库。组织可以比较国内和国际的菌株和类型。兰说，目前在其数据库中，全世界共有26000个沙门氏菌菌株。
Lan希望这种花了两年时间研究的方法能够帮助更容易地追踪食源性疾病的爆发，并且能够作为一个国际标准化的菌株鉴定系统来实施。
目前，该方法的目标是公共卫生，因此任何暴发都可以迅速识别，并向公众发出警报。
兰补充说，只要不限制公共卫生使用，团队愿意与商业伙伴合作。
该方法也可用于其他细菌。该团队目前正在研究其他食源性病原体，包括李斯特菌和产生志贺毒素的大肠杆菌。
